星湖科技建立了健全的質量管理組織架構，公司設立質量部，全面負責公司質量管理工作；各下屬廠均設置各自的質量科并設有廠的檢驗室，負責各自的中間體和成品的檢測；各車間還有檢驗室，負責生產過程的監(jiān)控，形成了一個由兩百多人組成的質量監(jiān)控體系。

公司擁有一支技術過硬、經驗豐富的質量管理團隊，配備了高效液相色譜、氣相色譜、原子吸收光譜儀、紅外分光光度計、紫外分光光度計等一大批先進分析儀器設備，為保障產品質量奠定基礎。

公司通過了ISO9001：2008質量管理體系認證；星湖生化制藥廠通過了GMP認證；利巴韋林產品通過了美國FDA認證；核苷酸產品通過了QS、HACCP、HALAL和KOSHER認證；肌苷、脯氨酸原料藥通過KOSHER認證； 脯氨酸產品通過歐洲藥典委員會COS認證；蘇氨酸產品通過HACCP認證和歐洲FAMI-QS認證。完善的質量管理體系保證了公司產品品質要求，產品深受客戶歡迎，遠銷歐、美、東南亞等許多國家。